Comme toute université,l'Université Montpellier 2 (UM2) est constituée de "composantes"
Elles sont au nombre de sept :

• Faculté des Sciences de Montpellier
• IUFM
• IUT Montpellier
• IUT Nîmes
• Polytech
• IAE
• IUT Béziers

Elles sont administrées chacune par un directeur, enseignant élu par le conseil de composante.
L'administration de l'ensemble de l'Université est assurée par trois conseils centraux :

Le conseil d'administration (CA)

• Il détermine la politique de l'établissement.
• Il vote le budget et approuve les comptes.
• Il fixe la répartition des emplois.
• Il approuve les accords et les conventions signés par le président ainsi que les différentes actions financières.
  

Le conseil des études et de la vie universitaire (CEVU)

• Il propose au CA les orientations de la formation dispensée, débat des projets de nouvelles filières ou des modalités d'examen.
• Il présente également des mesures visant à faciliter la vie de l'étudiant: orientation, validation des acquis, accès à la vie professionnelle, activités culturelles, sportives, sociales ou associatives, conditions de vie et de travail.
• Le CEVU examine les mesures relatives aux activités de soutien, aux œuvres universitaires et scolaires, aux services médicaux, aux bibliothèques et centres de documentation.
• Il est garant des libertés politiques et syndicales étudiantes.
  

Le conseil scientifique

• Il propose au CA les orientations politiques de recherche, de documentation scientifique et technique ainsi que la répartition des crédits de recherche.
• Il est consulté sur de nombreux programmes: formation continue, contrats de recherche, demandes d'habilitation à délivrer des diplômes nationaux, modification de diplômes d'établissement.

Ces trois conseils élisent chacun un vice-président d'université.
L'Université est dirigée par un président, enseignant élu par l'ensemble des trois conseils.
Tous ces conseils comprennent des représentants d'enseignants, de personnels IATOSS (ingénieur, administratif, technicien, ouvrier de service et de santé), de personnalités extérieures élues pour 4 ans, et d'étudiants.
Les représentants étudiants sont élus pour 2 ans par tous les étudiants de l'Université. Administrateurs à part entière de l'Université, ils participent aux délibérations au même titre que tous les autres membres.